El LAA, ha sido designado junto con el Centro Nacional de Alimentación, como Laboratorios Nacionales de Referencia en las pruebas y validación de métodos de detección y control de organismos modificados genéticamente. Ambos laboratorios desarrollan las funciones que tienen encomendadas como tales, siendo el LAA encargado de la organización de los ensayos intercomparativos dirigidos a los laboratorios oficiales de control de OGM's.