Resumen: Los directores de programas de investigaciones agrarias están sometidos a crecientes presiones para que justifiquen sus decisiones. El análisis empírico de las ventajas comparativas ofrece un potencial considerable para proporcionarles una información más precisa para sus decisiones. En este estudio se analizan las aplicaciones potenciales del análisis de costes de los recursos nacionales a la asignación de recursos a la investigación. Se presentan tres casos de investigación sobre trigo en Méjico, Ecuador y Tailandia. Los estudios sugieren formas en que podrían evaluarse y orientarse las investigaciones sobre el trigo. El método es de especial utilidad cuando los efectos de la política sean grandes, se estén contemplando nuevos cultivos y se esté prestando atención a varios objetivos nacionales. Tiene, en potencia, muchas aplicaciones para la toma de decisiones sobre asignación de recursos a la investigación agraria.